ضحايا الاختفاء القسري محرومون في الواقع من جميع حقوقهم ويصبحون تحت رحمة آسريهم
أبرز الحقوق التي تم انتهاكها:
الحق في الاعتراف بالشخص أمام القانون
الحق في الحرية والأمن للشخص
الحق في عدم التعرض للتعذيب وغيره من ضروب المعاملة أو العقوبة القاسية أو اللاإنسانية أو المهينة
الحق في الحياة عند مقتل الشخص المختفي
الحق في الهوية
الحق في محاكمة عادلة وفي الضمانات القضائية
الحق في سبيل انتصاف فعال، بما في ذلك جبر الضرر والتعويض
الحق في معرفة الحقيقة فيما يتعلق بظروف الاختفاء
كما تنتهك حالات الاختفاء القسري عمومًا مختلف الحقوق الاقتصادية والاجتماعية والثقافية لكل من الضحايا وأسرهم:
الحق في الحماية والمساعدة للأسرة
الحق في مستوى معيشي لائق
الحق في الصحة
الحق في التعليم